Institut Dayakologi memiliki empat (4) kantor untuk menunjang kegiatan, yakni; Kantor Pusat yang beralamat di Kota Pontianak dan tiga (3) sekretariat dilapangan, yaitu;

1. Sekretariat AMA-JK di Kampung Tanjung, Desa Tanggerang, Kec. Jelai Hulu, Kab. Ketapang

2. Sekretariat KTK-TAE di Kampung Tae, Desa Tae, Kec. Balai Batang Tarang, Kab. Sanggau

3. Sekretariat KTJ-Segumon, di Kampung Segumon, Desa Lubuk Sabuk, Kec. Sekayam, Kab. Sanggau